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      Nature 子刊 |我国科学家揭示非洲猪瘟病毒DNA连接酶的分子机制

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      Nature 子刊 |我国科学家揭示非洲猪瘟病毒DNA连接酶的分子机制

      发布日期:2019-01-28 作者: 点击:

      最新科研成果

      复旦大学及四川大学合作发现非洲猪瘟病毒易错DNA连接酶的关键位点残基 ,引起了极大关注 。是否距离大家翘首以盼非洲猪瘟疫苗的问世又进了一步呢?

      2019年1月23日,复旦大学甘建华、李继喜及四川大学/佐治亚州立大学黄震共同通讯等在Nature Communications 上发表题为“Structure of the error-prone DNA ligase of African swine fever virus identifies critical activesite residues”的文章,报道了四个独特的活性位点残基(AD结构域的Asn 153和Leu 211;OB结构域的Leu 402和Gln 403)对AsfvLIG的催化效率至关重要。

      该研究用X-射线晶体学方法解析了AsfvDNAL与不同类型DNA复合物的结构 ,揭示了AsfvDNAL结合和催化底物连接的分子机制,为针对非洲猪瘟病毒DNA修复通路蛋白的药物设计提供了结构基础 。

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      图1. AsfvDNAL与DNA底物复合物的晶体结构

      ASFV病毒是一种独特的双链DNA病毒,既能感染野生猪,也能感染家猪。一旦爆发,将会导致近100%受感染猪的死亡。自1921年被发现以来 ,ASFV病毒受到了科研人员的广泛关注,但目前仍没有任何有效的疫苗被报道 。ASFV病毒对全球多个国家和地区的猪饲养业都是一种巨大的威胁,并于2018年在中国首度爆发,导致了严重的经济损失。

      ASFV病毒编码了多个蛋白,形成了一套完整的DNA修复通路。与通常的DNA修复通路不同,ASFV DNA修复通路中的DNA 聚合酶(AsfvPolX)和连接酶(AsfvDNAL)的保真性都非常低,在ASFV病毒基因组的修复和突变过程中均发挥了关键作用。本团队早期研究发现,AsfvPolX拥有一个独特的磷酸根识别位点,对其底物结合和催化活性十分关键(Plos Biology, 2017)。

      本文主要讨论了AsfvDNAL 。AsfvLIG由419个氨基酸组成,是迄今发现的最小的DNA连接酶之一,并且是迄今为止发现的最易出错的连接酶之一,它催化ASFV DNA修复过程中的DNA连接反应,在病毒基因组的诱变中起着重要作用 。

      AsfvLIG在中心有一个腺苷化结构域(AD),在C端有一个OB折叠结构域(OB);AD和OB结构域在同源蛋白中都是保守的 。除了AD和OB结构域外 ,许多DNA连接酶都有一个DNA结合域(DBD),这对于底物结合和连接过程至关重要,而AsfvLIG的N端区域(NTD)与其他连接酶DBD结构域没有相似之处。

      AsfvLIG包含四个独特的残基,包括AD域的Asn 153和Leu 211,以及OB结构域的Leu 402和Gln 403 。虽然他们不参与直接催化过程,这些残基可能与其相应的NTD或DBD结构域协同工作,这些位点残基对缺口的识别和催化效率有着重要的意义。

      该文章发现的4种独特的结构特征可以作为小分子设计的潜在靶点 ,这可能会损害ASFV的基因组修复,并有助于今后对抗这种病毒。

      该项目得到了国家自然科学基金(31870721 ,31470724,31670878,21572146 ,21761132029)和中国重点研发项目(2016YFA0500600),四川省重点研发项目(2018NZ0151)资助项目。


      本文网址:https://www.0512idc.net/news/467.html

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